موسسه مهرآفرین در جهت گسترش فعالیت های حمایتی خود در سراسر کشور، به خصوص در مناطق محروم ، مجوز فعالیت کشوری از سازمان بهزیستی دریافت کرد. با دریافت این مجوز، مسئولان موسسه می توانند خدمات بیشتری مانند آموزش، مشاوره روانشناسی ، بهداشت و درمان..... را به مددجویان تحت پوشش موسسه ارائه دهند.
مهرآفرین در سال 1385 مجوز فعالیت در سطح استان تهران را از بهزیستی دریافت کرده بود.